Mako jest młodą syrenką, która zafascynowana światem ludzi postanawia opuścić morskie królestwo, aby zamieszkać na powierzchni. Porzucając podwodny pałac oraz rodzinę, dziewczyna otrzymuje magiczny klejnot pozwalający jej przybrać ludzką postać. Mako trafia do ludzkiego miasta, gdzie usiłuje zrozumieć nową rzeczywistość oraz nawiązać szczere relacje. Początkowy entuzjazm spotyka się jednak ze zderzeniem marzeń z rzeczywistością, gdy syrenka odkrywa, że życie na lądzie bywa trudniejsze, niż przypuszczała. Mahou no Mako-chan to klasyczna, ciepła opowieść o dojrzewaniu, poszukiwaniu własnego miejsca oraz sile przyjaźni i miłości, przedstawiona w pogodnym i optymistycznym stylu, przepełnionym magiczną atmosferą bajkowego świata lat 70.
