„Mahoujin Guruguru” to historia osadzona w malowniczej wiosce Jimuna na kontynencie Jamu Jamu. Spotkamy tam dziewczynkę Kukuri – ostatnią potomkinię plemienia Migu Migu, wychowaną przez starą czarownicę, która uczyła ją tajemnej magii plemienia. Kukuri nie jest jednak najlepszą uczennicą.
W tej samej wiosce mieszka chłopiec o imieniu Nike. Wychowany w surowym domu, zmuszany przez rodziców do zostania bohaterem wioski, mimo że sam wcale nie pragnie tego.
Pewnego dnia król wioski, Kodai, werbuje żołnierzy do walki przeciwko władcy ciemności, Giri. Kukuri i Nike dołączają do walki. Na ich drodze czeka wiele przygód i przyjaźni. Dzielny, choć niechętny bohater Nike oraz pełna zapału, lecz niezbyt zręczna czarodziejka Kukuri wyruszają w niezapomnianą podróż.