„Marmalade Boy” to pełna zwrotów akcji historia o licealistce imieniem Miki Koishikawa, która niespodziewanie zostaje wplątana w skomplikowane i niespodziewane małżeńskie perypetie swoich rodziców. Po niecodziennych wakacjach na Hawajach, zupełnie zaskakuje ją decyzja rodziców o rozwodzie i zamianie partnerów z inną parą, którą poznali podczas ostatniej podróży. Przyjazne spotkanie z nową rodziną może i byłoby do zniesienia, gdyby nie fakt, że syn nowej pary to przystojniak, Matsuura Yuu, który z miejsca wpada jej w oko. Między dwojgiem młodych rodzi się uczucie, które jednak nie jest wolne od przeszkód – nie tylko z ich własnego serca, ale i z zewnątrz, ze strony zazdrosnych wielbicieli.