„Mekakucity Records” to kontynuacja „Mekakucity Days”, w której dalej poznajemy historie członków grupy „Mekakushi-dan”. Spotkamy tu Shuuyę Kano, naturalnie urodzonego kłamcę, którego czerwone oczy dają mu moc manipulowania wyglądem. Ale czy to on jest tym prawdziwym Kano, czy też to kolejne kłamstwo? Shintarō Kisaragi, nawiedzony przez duchy przeszłości, szuka rozwiązania swoich problemów. Czy jednak będzie w stanie ruszyć dalej, czy pozostanie zamknięty w swoich żalach? Ayano Tateyama staje się starszą siostrą dla trójki czerwonookich sierot. Mimo ich smutku, Ayano zrobi wszystko, by zatroszczyć się o nich. Przywdziewa czerwony szalik, zakłada tajny klub Mekakushi-dan i pokazuje piękno czerwonych oczu swojej nowej rodziny.