W trakcie tzw. Wojny Jednorocznej, Federacja Ziemska i Księstwo Zeonu prowadzą brutalny konflikt który sięga nawet odległych terenów dżungli Azji Południowo-Wschodniej. Młody oficer Shiro Amada obejmuje dowództwo nad 08. zespołem mobilnych kombinezonów Federacji, wyspecjalizowanej jednostki naziemnej, której zadaniem jest walka z siłami Zeonu. Podczas jednej z misji Shiro spotyka Ainę Sahalin – pilotkę Zeonu, której obecność i przekonania głęboko go poruszają. Pragnąc ochronić swój oddział i zakończyć krwawy konflikt, młody dowódca musi zmierzyć się nie tylko z wrogimi wojskami, ale również własnymi wątpliwościami i granicami moralnymi. „Mobile Suit Gundam: The 08th MS Team” przedstawia realistyczne podejście do wojny, skupiając się na zwyczajnych żołnierzach, przyjaźni, poświęceniu i trudnych wyborach w obliczu zaciekłego konfliktu.
