Historia przedstawia perspektywę sił Księstwa Zeon podczas dramatycznych wydarzeń rozgrywających się równolegle do oryginalnego konfliktu z serii Mobile Suit Gundam. Grupa elitarna zwana Midnight Fenrir Corps, dowodzona przez ambitnego oficera Geralda Sakai, podejmuje się tajnych i wyjątkowo niebezpiecznych misji bojowych mających zmienić przebieg wojny z Federacją Ziemską. Bohaterowie muszą stawić czoła wewnętrznym konfliktom moralnym, ciężkiemu brzemieniu rozkazów oraz ryzyku utraty życia w imię lojalności wobec Zeonu. Seria koncentruje się na realizmie wojny, prezentując jej trudne wybory, napięcie i dramaty ludzi uwikłanych w starcie gigantycznych robotów bojowych. „Mobile Suit Gundam: Zeonic Front – Indignation of Zeon” ukazuje konflikt z perspektywy drugiej strony barykady, wzbogacając oryginalny świat Gundama o głębię emocjonalną i refleksję nad granicami honoru i poświęcenia.
