Akcja anime rozgrywa się w powojennej Japonii lat 50. XX wieku, gdzie atmosfera napięcia miesza się z aurą mistycyzmu oraz mrocznych legend miejskich. Seria rozpoczyna się od tajemniczej serii makabrycznych zdarzeń, związanych z dziwnymi zbrodniami oraz niewyjaśnionymi zniknięciami. Prywatny detektyw oraz pisarz zajmujący się folklorem i okultyzmem zostają wciągnięci w śledztwo dotyczące brutalnych morderstw, które zdają się mieć paranormalne korzenie. W trakcie dochodzenia bohaterowie konfrontują się z mitologicznymi istotami zwanymi „mouryou” oraz natrafiają na zagadkowe pudełko pełne sekretów. „Mouryou no Hako” cechuje się mrocznym, psychologicznym klimatem, w którym granice między prawdą, szaleństwem a nadnaturalnym zacierają się nieodwracalnie.

