Yato jest drobnym, bezdomnym bogiem, który marzy o posiadaniu własnej świątyni oraz licznych wiernych. Jednak obecnie zajmuje się drobnymi, banalnymi zleceniami za symboliczną sumę pięciu jenów. Pewnego dnia podczas wykonywania jednego ze swoich nieistotnych zadań, los splata go z nastoletnią dziewczyną Hiyori Iki, która po wypadku samochodowym odkrywa, że jej dusza może opuszczać ciało. Aby odzyskać swoje normalne życie, Hiyori postanawia pomóc Yato w zdobyciu sławy i wiernych, licząc na to, że bóg pomoże jej w powrocie do zdrowia. W międzyczasie Yato znajduje sobie nową broń – duszę zagubionego chłopca nazwanego Yukine. Razem stawiają czoła złowrogim duchom, osobistym problemom oraz własnej skomplikowanej przeszłości. Noragami to dynamiczna, przepełniona akcją i humorem opowieść o nadnaturalnym świecie współczesnej Japonii.
