„Persona 4 the Golden Animation” to historia młodego mężczyzny o imieniu Yu Narukami, który przeprowadza się do małego miasteczka na prowincji, gdzie mieszka jego wuj. Yu rozpoczyna nowe życie ucząc się w lokalnym liceum – Yasogami High. Spokojne, wiejskie życie zostaje jednak zakłócone serią tajemniczych morderstw. Po szkole, w lokalnym centrum handlowym, dostrzega też dziwny kanał, który nadaje tylko o północy. Czy Yu i jego przyjaciele są w stanie sprostać niespodziewanym wydarzeniom?