„Pokemon Best Wishes!” to kolejna odsłona popularnej serii, tym razem przenosząca nas do odległego regionu Isshu. Tylko Satoshi i jego Pikachu ruszają w nieznane. Spotykają nowego trenera i rywala, Shooty oraz profesora Araragi. Dołączają do nich także Iris, dziewczyna z miasta znanej z smoczych Pokemonów, oraz Dent, koneser Pokemonów i specjalista od Pokemonów Trawiastych, który jest jednym z trzech Liderów Sali Sanyou City. Przygotuj się na nowe przygody i nieznane sfery świata Pokemon!