„W Pokemon Best Wishes! Season 2, Satoshi, Iris i Dent kontynuują swoje podróże po regionie Isshu. Po zdobyciu 8. odznaki z siłowni w Tachiwaki City, Shirona zaprasza wszystkich do swojej willi na wschodzie Isshu, gdzie przebywa stara przyjaciółka Hikari. Tam mają okazję uczestniczyć w Młodzieżowym Pucharze Świata Pokemon, zanim Satoshi przystąpi do Ligi Unova. Tymczasem, Team Rocket wprowadza w życie swój ostateczny plan dla regionu Isshu – jaki jest ich cel w poszukiwaniu legendarnego Pokemona Meloetta?”