„Pokemon: The Origin” to fascynująca opowieść o wielobarwnym świecie Pokemonów, cudownych stworzeniach, z których każde ma unikalne zdolności, moc i osobowość. Yukinari Ookido, naukowiec poświęcający życie ich badaniu, powierza dwóm młodym chłopcom – Zielonemu i Czerwonemu – własne Pokemony i komputerową encyklopedię do ich katalogowania.
Podążamy tu za czerwonym, który podróżuje przez region Kanto, starając się ukończyć swój „Pokédex”, czyli katalogować wszystkie istniejące Pokemony. Na jego drodze stają jednak nie tylko dzikie Pokemony i rywale, ale również siły zła, takie jak przestępcza organizacja Team Rocket.
Czy Czerwony okaże się na wysokości zadania, pokonując zarówno swoje osobiste wyzwania, jak i przeciwności losu, aby stać się Mistrzem Pokemonów?