W schyłkowym okresie ery Edo, w czasie gwałtownych przemian, młody Kenshin Himura staje się bezwzględnym zabójcą służącym sprawie obalenia dawnego porządku i zbudowania nowego, sprawiedliwszego świata. Znany jako legendarny Hitokiri Battousai (człowiek-zabójca, władający mieczem), Kenshin męczony jest poczuciem winy i cierpieniem, które przynosi mu każda odebrana ofiara. Wkrótce jego życie odmienia spotkanie z tajemniczą kobietą, Tomoe Yukishiro, której losy okazują się nierozerwalnie połączone z dramatyczną przeszłością Kenshina. Próbując odnaleźć sens oraz odkupienie, protagonistę czeka trudna droga pełna bólu, miłości i zdrad, zmuszająca go do kwestionowania swojej tożsamości oraz drogi, którą obrał. Seria posiada poważną, melancholijną atmosferę i przedstawia mroczną przeszłość jednego z najbardziej znanych szermierzy w historii anime.
