Drugi sezon Sasaki to Pii-chan przedstawia dalsze przygody Sasakiego, średnio zaawansowanego salarymana, oraz jego niezwykłego towarzysza – ptaszka o imieniu Peeps. Po zakończeniu rutynowego życia, Sasaki i Peeps kontynuują swoje niezwykłe wyprawy pomiędzy rzeczywistym światem a równoległym światem, gdzie nasz bohater staje się częścią organizacji walczącej z niebezpiecznymi „Irregulars”. Równolegle w świecie równoległym konflikt zbrojny zagraża kraju, który stał się bliski Sasakiemu. W drugim sezonie rozwijają się zarówno relacje między głównymi bohaterami, jak i wyzwania, z którymi muszą się zmierzyć w obu rzeczywistościach.