„Shikabane Hime: Aka” to tajemnicza historia Ouriego Kagamiego, sieroty mieszkającego w świątyni, który nie jest obcy trupom. Jego życie odmienia się jednak, gdy jest świadkiem, jak opiekun sierocińca, Keisei Tagami, ożywia zdeformowane ciało szkolnej dziewczyny, Makiny Hoshimury. Okazuje się, że Makina to Shikabane Hime – nieumarły, który ma za zadanie eliminować inne istoty takie jak ona, stanowiące zagrożenie dla społeczeństwa. Losy Ouriego i Makiny zaczynają się przecinać, a ich spotkania stają się coraz bardziej intensywne. To, jak potoczą się ich losy, może być kluczem do odkrycia sekretów świata Shikabanes.