„Shuumatsu no Izetta” to historia zmagań dawnego małego alpejskiego państwa Elystadt ze zdecydowanie silniejszym militarnie wrogiem, Germanią, która podczas II wojny światowej stanęła na celowniku tego kraju. Sytuacja Elystadt staje się jeszcze gorsza, gdy Princessa Ortfiné „Finé” Fredericka von Eylstadt zostaje pojmana. Jednak los przynosi im niespodziankę w postaci Izetty, ostatniej żyjącej czarownicy, która ucieka z rąk Germanów. Izetta, rozpoznając princessę Finé ze swojego dzieciństwa, wykorzystuje swoje magiczne zdolności, aby uratować ją i oświadcza, że chce pomóc Elystadt w walce z Germanią. Dzięki Izettie, Elystadt ma szansę przeciwstawić się imperialistycznemu gigantowi.