„Super Milk-chan” to zabawna parodia szpiegowskich filmów z lat 70. Główną bohaterką jest Milk-chan, dziewczynka, która mieszka w domku przyklejonym do budynku wraz ze swoimi współlokatorami: paranoicznym robotem przypominającym butelkę, Tetsu-ko, oraz Hanage, zieloną plamą z wąsem. Mimo braku pieniędzy na czynsz, Milk-chan otrzymuje tajemniczą pracę od samego prezydenta. Wraz ze swoją ekipą, śmigłowcem „Milk-6”, Milk-chan wyrusza na misje, zawsze odbierając telefon od Prezydenta słowami „Halo, Bank Hokkaido. Żartuję!”.