„Tomo-chan wa Onnanoko!” to historia o przyjaźni między Tomo Aizawą a Junichirou Kubotą, którzy robią wszystko razem, czy to treningi, czy po prostu miły dzień na mieście. Tomo jest wyjątkową dziewczyną, która jednak jest zakochana w Junie. Na początku swojego pierwszego roku liceum, Tomo postanawia wyznać Junowi swoje uczucia. Wyzwanie polega na tym, że Jun traktuje Tomo jak swojego brata. Czy Tomo uda się przekonać Juna do zmiany odczucia?