W roku 2199 ludzkość stoi na krawędzi zagłady po wyniszczającej wojnie przeciwko tajemniczej kosmicznej rasie Gamilas. Ziemię dotyka katastrofa nuklearna, a jej powierzchnia staje się niezdatna do życia. Jedyną nadzieją na ratunek jest kosmiczny okręt wojenny „Yamato”, wyposażony w zaawansowaną technologię od nieznanych dotąd sojuszników. Pod dowództwem doświadczonego kapitana Okity oraz zdeterminowanego oficera Susumu Kodai, załoga Yamato wyrusza na niebezpieczną podróż, aby odnaleźć sposób na ocalenie swojej planety. Podczas pełnej napięcia misji kosmonauci muszą stawić czoła agresywnym przeciwnikom, narastającemu poczuciu beznadziei i własnym wątpliwościom. „Uchuu Senkan Yamato 2199: Tsuioku no Koukai” jest kompilacją filmową serii, skupiając się na najważniejszych momentach tej epickiej podróży i przedstawiając je w formie wspomnień. Anime utrzymane jest w poważnej, emocjonalnej atmosferze, pełnej dramatycznych momentów i spektakularnych bitew kosmicznych.
