Touta Konoe prowadzi zwyczajne życie w spokojnej wiosce, gdzie marzy o wyruszeniu w świat pełen przygód i niezwykłych zjawisk. Jest typowym nastolatkiem, który nie zdaje sobie sprawy ze swojej prawdziwej natury oraz tajemniczej przeszłości otaczających go ludzi. Jednak jego spokojne dni szybko się kończą, gdy w wyniku dramatycznych wydarzeń odkrywa swoją nieśmiertelność i zaangażuje się w walkę między mocami dobra i zła. Touta trafia pod opiekę tajemniczej organizacji nieśmiertelnych, zwanej UQ Holder, której członkowie strzegą równowagi między światem nadnaturalnym a ludźmi. Teraz, wśród barwnych towarzyszy, Touta musi zmierzyć się ze swymi nowymi umiejętnościami oraz przeciwnościami losu, odkrywając sekrety przeszłości, które łączą go z legendarną postacią – Negim Springfieldem. Utrzymane w lekkim, lecz dynamicznym stylu fantasy, anime stanowi prequel i zarazem kontynuację uniwersum Mahou Sensei Negima!, oferując zarówno humor, jak i porywające sceny akcji.
