„Youkai Watch” to fascynująca opowieść o młodym uczniu podstawówki, Keicie Amano. Gdy pewnego dnia decyduje się zagłębić w głąb lasu, napotyka małą i tajemniczą kapsułkę, z której wyłania się Whisper – duchowa istota, która była uwięziona przez 190 lat. W ramach podziękowania za wolność, Whisper staje się strażnikiem Keity, chroniąc go przed siłami nadnaturalnymi. Dzięki zegarkowi Youkai, który otrzymuje od Whispera, Keita zyskuje możliwość widzenia i interakcji z innymi Youkai. Wraz z Whisperem i duchem kota, Jibanyanem, Keita przeżywa niezwykłe przygody, pomaga Youkai i uczy się cennych lekcji życia.