„Full Metal Panic? Fumoffu” to kolejny rozdział pełen humoru i akcji w życiu Sierżanta Sousuke Sagary i Kaname Chidori. Sousuke, choć na pozór niezdarny, desperacko próbuje chronić Kaname – cenne aktywo wojenne. Jego brak umiejętności społecznych i doświadczenia życiowego prowadzi do śmiesznych, a jednocześnie niebezpiecznych sytuacji w szkolnym środowisku Kaname. Sousuke, nie potrafiąc odróżnić realnego zagrożenia od fikcyjnego, wprowadza do szkoły całą gamę broni, podczas gdy Kaname stara się nad nim zapanować i równocześnie pełnić obowiązki wiceprezesa samorządu uczniowskiego. Sousuke od czasu do czasu przebiera się za maskotkę znanej parku rozrywki – Bonta-kuna, przerabiając kostium na wysoce zaawansowany egzoszkielet. Ten absurdalny duet stara się przetrwać swoje codzienne życie szkolne mimo chaosu, który nieustannie wywołują.