Akcja czwartej części miniserii „Koukaku Kidoutai Arise” rozgrywa się w futurystycznym mieście, gdzie granice między technologią a człowieczeństwem stopniowo zanikają. W centrum wydarzeń stoi major Motoko Kusanagi, cybernetycznie ulepszona specjalistka, dowodząca jednostką specjalną Sekcja 9. Tym razem Kusanagi staje wobec enigmatycznego przeciwnika, który wydaje się znać jej przeszłość i ukryte tajemnice zespołu, kwestionując lojalność jej najbliższych współpracowników. W tle piętrzących się intryg politycznych, cybernetycznych ataków i tajemniczych morderstw, Motoko musi stawić czoła własnym duchom przeszłości oraz odpowiedzieć na pytania dotyczące granic własnej tożsamości. Anime utrzymane jest w poważnej, refleksyjnej stylistyce cyberpunkowej, w której dynamiczna akcja, thriller polityczny i psychologiczne elementy łączą się z głębszymi pytaniami o znaczenie świadomości i istotę człowieczeństwa.
