W niedalekiej przyszłości technologia cybernetyczna i sieciowa całkowicie przeniknęła życie codzienne ludzkości. Major Motoko Kusanagi, cyborg będący liderką elitarnego oddziału bezpieczeństwa Sekcja 9, oraz jej zespół stają przed nowym wyzwaniem, które może zachwiać stabilnością świata. Tajemnicza sprawa cyberprzestępczości prowadzi Major w sam środek międzynarodowej intrygi, zmuszając ją jednocześnie do stawienia czoła zagadkom własnej przeszłości. Walcząc z cyberterrorystami i rywalizującymi frakcjami politycznymi, Sekcja 9 odkrywa spisek daleko bardziej złożony, niż można było przypuszczać. W pełnej napięcia atmosferze politycznych intryg, technologicznego zagrożenia i filozoficznych refleksji na temat granic między człowieczeństwem a maszyną, Motoko musi odnaleźć prawdę, zanim będzie za późno.
