„Misaki no Mayoiga” to poruszająca historia o 8-letniej Hiyori, która straciła rodziców, oraz Yui, próbującej uciec przed swoim przemocowym ojcem. Ich losy zmieniają się po wielkim trzęsieniu ziemi i tsunami. Zdezorientowane i bez tożsamości, zostają uratowane przez starszą kobietę o imieniu Kiwa Yamana, która proponuje im wspólne życie w starym domu „Mayoiga” z widokiem na morze. W ten sposób zaczyna się ich nowa, niezwykła egzystencja.