„Popotan” to niezwykła podróż przez czas i przestrzeń, którą odbywają piękne siostry Ai, Mai, Mii, ich androidowa pokojówka Mea oraz zwodniczy fret Unagi. Cała ta niezwykła podróż odbywa się nie opuszczając ich ukochanej rezydencji! Podążając za wskazówkami tajemniczych „Popotan”, dziewczynki dążą do osoby, która ma odpowiedzi na ich najbardziej osobiste pytania. Po drodze mają jednak mnóstwo czasu na poboczne wyprawy, poznawanie nowych przyjaciół, odwiedzanie gorących źródeł, a nawet prowadzenie świątecznego sklepiku w swoim domu! Niemniej jednak, ich ostateczna misja kryje w sobie wiele niespodzianek, a poruszanie się w czasie często oznacza konieczność żegnania się z przyjaciółmi.