Jest rok 1928, a duch walki w obronie pokoju ponownie budzi się w świecie „Sakura Taisen”. Tym razem akcja przenosi się do tętniącego życiem Nowego Jorku, gdzie siły zła znów próbują zaburzyć harmonię ludzi i duchów. Oto opowieść, której centrum stanowi nowa grupa bohaterskich dziewcząt—Nowojorski Oddział Kwiatów. Młoda Japonka Shinjiro Taiga zostaje przydzielona do zespołu w roli powiernika, przewodnika i dowódcy, integrując się z nowymi sojuszniczkami, których osobowości i cele różnią się niemal równie mocno, jak ich specjalne zdolności.
Pełna humoru, muzyki oraz intensywnych bitew opowieść koncentruje się wokół wzrastającego zagrożenia mrocznymi siłami w wielkim mieście. Shinjiro będzie musiała nie tylko poprowadzić drużynę do zwycięstwa, ale również przezwyciężyć różnice kulturowe i osobiste obawy. Czy nowy oddział będzie gotów obronić Nowy Jork przed nieuchronnym zagrożeniem?
