„Battle Girl High School” to anime oparte na grze akcji COLOPL. Akcja rozgrywa się w roku 2045, gdy Ziemia zostaje skażona przez tajemniczych najeźdźców Irousu, co skutkuje ograniczeniami dla ludzkości. Odważnie stawiają im czoła zwykłe dziewczyny, bez potężnej armii czy broni.
Akademia Dziewcząt Shinjugamine to szkoła dla „Hoshimori” (Strażniczek Gwiazd), które są przeznaczone do walki z Irousu. Gracz jest przypisany do tej akademii, aby szkolić dziewczyny i odzyskać skażoną Ziemię. I tak, raz jeszcze, dzwonki rozbrzmiewają na nasłonecznionym dziedzińcu szkoły, oznajmiając początek kolejnych zajęć…