„Bullbuster” przedstawia historię Tetsurou Okino, młodego inżyniera, który zostaje przeniesiony do firmy zajmującej się zwalczaniem szkodników, Hato Industries. Tam, wraz z prezesem Tajimą, staje w obliczu tajemniczej istoty. Przy użyciu stworzonego przez siebie robota Bullbustera, Tetsuro musi pokonać przeciwności, zmagając się nie tylko z problemem szkodników, ale również z finansową rzeczywistością. Czy ich ideały zwalczania szkodników połączą się z brutalną prawdą o ograniczonym budżecie? Co przyszłość ma dla Hato?