„Absolute Duo” to anime, w którym osoby zdolne materializować broń wychodzącą z ich duszy, zwane „Blazers”, uczęszczają do liceum Kouryou Academy, by rozwijać swoje zdolności. Każdy uczeń musi nawiązać partnerstwo z innym, z nadzieją, że pewnego dnia zdobędą moc Absolute Duo.
Główny bohater, Tooru Kokonoe, dołącza do akademii z nadzieją na zdobycie mocy, po tym jak jego siostra i przyjaciele zostali zamordowani przez tajemniczego mężczyznę. Jednak na ceremonii otwarcia, jest zmuszony do pojedynku z osobą siedzącą obok niego, a przegrany zostaje wydalony. Kiedy Tooru szykuje się do walki, to nie broń, ale tarcza manifestuje się z jego duszy. Ta niekonwencjonalna sytuacja przyciąga uwagę zagranicznej studentki o imieniu Julie Sigtuna.