Świat ogarnęło przerażenie, gdy wyszło na jaw istnienie tajemniczych istot zwanych Ajin—nieśmiertelnych pół-ludzi, którzy odradzają się po każdej śmierci. Społeczeństwo traktuje ich jak potwory, poddając instynktownej izolacji i bezwzględnym eksperymentom. Akcja serii OVA ukazuje dramatyczne wydarzenia znane jako incydent Shinyi Nakamury, opisując losy bohatera, zwyczajnego ucznia liceum, którego życie zmienia się diametralnie po odkryciu mrocznej prawdy o sobie samym. Gdy chłopak dowiaduje się, że jest jednym z Ajinów, musi ukrywać się i walczyć o przetrwanie, uciekając przed łowcami nagród oraz brutalnymi agentami rządowymi, chcącymi go schwytać i wykorzystać. Ajin OVA przedstawia mroczny, psychologiczny thriller pełen napięcia i dynamicznej akcji, w którym bohater zmuszony jest zmierzyć się z ludzkimi uprzedzeniami oraz własnymi wewnętrznymi demonami.
