W mrocznym, skąpanym neonowym blaskiem mieście Rags Town, działają dwaj detektywi, Shuu i Akira, podejmujący się spraw, przed którymi inni cofają się w obawie. Pewnego dnia ich rutynowa praca całkowicie się zmienia, gdy zostają uwikłani w tajemniczą sprawę dotyczącą niezwykłej dziewczyny o ciele ze szkła. Próbując rozwikłać zagadkę jej pochodzenia, obaj mężczyźni wchodzą w świat ukrytych eksperymentów, mrocznej przeszłości i zagadkowych organizacji. Pełne akcji śledztwo przeradza się w niebezpieczną grę, gdzie nie wiadomo, komu można zaufać, a cień podejrzeń pada na każdego. „Crystal Blaze” łączy w sobie elementy kryminału noir, science-fiction oraz dramatu, budując atmosferę niepewności i zagrożenia, gdzie przyszłość zależy od rozwiązania kryształowej tajemnicy.