Liceum Hope’s Peak Academy to prestiżowa placówka, do której co roku przyjmowani są tylko najbardziej utalentowani uczniowie. Makoto Naegi, zwyczajny nastolatek, zostaje przyjęty jako „Najszczęśliwszy uczeń”. Jednak to, co miało być początkiem wyjątkowej przygody, staje się koszmarem – Makoto budzi się zamknięty razem z grupą innych uczniów w odizolowanej akademii. Tajemniczy i sadystyczny niedźwiedź Monokuma oznajmia im, że jedyną szansą na wydostanie się na wolność jest popełnienie morderstwa jednego ze współuczniów, unikając przy tym wykrycia. Atmosfera szybko staje się napięta, a uczniowie są zmuszeni rozwiązywać kolejne zagadki, prowadzić śledztwa i stawić czoła swoim najgłębszym lękom. „Danganronpa: The Animation” to pełen mrocznej tajemnicy dramat psychologiczny, który eksploruje granice ludzkiej moralności w obliczu desperacji, nadziei oraz rozpaczy.
