„Dr. Stone: Nowy Świat” to ekscytująca opowieść o ambitnym nauce, Senkuu Ishigami, który razem ze swoim zespołem, w tym zasużonym żeglarzem Ryuusui Nanami, planuje popłynąć w nieznane, w kierunku miejsca pochodzenia tajemniczego, zielonego światła, które zmieniło ludzi w kamienie. Wszystko zmienia się, kiedy naukowiec otrzymuje niepokojącą wiadomość z nieznanego źródła. Bez względu na to, jakie niebezpieczeństwa mogą czaić się w nieznanym, Senkuu jest gotów na wszystko, z pomocą nauki.