„Full Metal Panic!” to anime, które opowiada o tajnej wojskowej organizacji o nazwie Mithril. Wykorzystując nowoczesne technologie do zwalczania działań terrorystycznych, Mithril przydziela specjalny zespół do wrażliwej misji. Pod dowództwem doświadczonej oficer Melissa Mao, sierżanci Sousuke Sagara i Kurz Weber mają za zadanie chronić nastolatkę o imieniu Kaname Chidori, która nieświadomie posiada przełomową wiedzę naukową i jest uważana za „Szeptaną”.
Sousuke musi jednak zaadoptować się do codziennego życia, ze względu na swoje wojskowe wychowanie i brak umiejętności społecznych, co jest dla niego dużym wyzwaniem.