Kohina Ichimatsu jest małą dziewczynką prowadzącą samotne, nietypowe życie – uważa siebie za lalkę i całkowicie pozbawia się emocji. Pewnego dnia dla zabawy wywołuje ducha zwanego Kokkuri-san, popularnego w japońskiej grze wróżebnej. Nieoczekiwanie na jej wezwanie odpowiada prawdziwy lis-duch imieniem Kokkuri, który zamiast odejść po zakończeniu gry, postanawia zamieszkać razem z dziewczynką. Ku swojemu przerażeniu Kokkuri-san odkrywa, że Kohina żywi się wyłącznie tanią żywnością typu instant, co budzi w nim ojcowskie instynkty opieki nad dzieckiem. Niedługi czas później do jej dziwnego domu dołączają kolejne nadprzyrodzone stworzenia, między innymi agresywny pies-duch Inugami czy łasy na alkohol Tanuki o imieniu Shigaraki. „Gugure! Kokkuri-san” to komedia pełna absurdu, której sercem jest nietypowa relacja między dziewczynką a grupą duchów usiłujących nauczyć ją prowadzenia normalniejszego, zdrowszego życia.

