„Hinako Note” to historia Hinako Sakuragi, dziewczyny urodzonej i wychowanej na prowincji Japonii, która boi się rozmawiać z nowymi ludźmi, aż do takiego stopnia, że przypomina sztywnego stracha na wróble. Aby to pokonać, Hinako pragnie wziąć udział w teatrze, inspirowana sztuką, którą zobaczyła podczas wycieczki szkolnej. W związku z tym przenosi się do willi Hitotose w tętniącym życiem Tokio, aby studiować w liceum Fujiyama i dołączyć do znanego w szkole teatru. Jednak ku jej rozczarowaniu, dowiaduje się, że teatr w liceum Fujiyama jest na długim urlopie. Właścicielka willi Hitotose, Chiaki Hagino, zauważa jej rozczarowanie i zachęca do założenia trupy teatralnej z mieszkańcami willi. „Hinako Note” śledzi Hinako, jak zaczyna nowe życie w Tokio, uczęszczając do liceum Fujiyama, jednocześnie ucząc się podstaw teatru z pomocą swoich przyjaciół.