Kouta Oyamada wydaje się zwyczajnym i nieśmiałym chłopakiem pragnącym spokojnego życia szkolnego, jednak sytuacja zmienia się diametralnie, kiedy zaczyna uczęszczać do nowej szkoły. Niebawem odkrywa, że jego starsza koleżanka, pełna energii i nad wyraz nieśmiała Chizuru Minamoto, jest tak naprawdę duchem lisa (kitsune). Urzeczona niewinnością i uprzejmością Kouty, Chizuru z determinacją okazuje swoje uczucia w sposób dość śmiały i nieprzewidywalny. Sprawę komplikuje jeszcze bardziej nadejście kolejnej dziewczyny, Nozomu Ezomori, która okazuje się wilczym duchem i także zaczyna rywalizować o względy chłopaka. Kanokon to pełna humoru, lekkiego romansu i komediowych sytuacji opowieść, w której świat ludzi przenika się z mitologią japońskich duchów oraz demonów, czyniąc codzienne życie bohatera niezwykle barwnym.

