Historia kontynuuje wydarzenia filmu „Macross Frontier: Itsuwari no Utahime”, przedstawiając dramatyczne i spektakularne zakończenie podróży kolonii Frontier przez odległą galaktykę, poszukując nowego domu dla ludzkości. W samym środku międzygwiezdnego konfliktu o przetrwanie ludzie stają do walki z tajemniczą rasą obcych istot zwanych Vajra. Pilot Alto Saotome ponownie musi zmierzyć się z odpowiedzialnością pilota myśliwca bojowego oraz trudnym wyborem serca między dwiema niezwykłymi dziewczynami: piękną i wrażliwą piosenkarką Ranką Lee a słynną gwiazdą pop, Sheryl Nome. Pełna akcji, muzyki oraz emocjonalnych zwrotów wydarzeń opowieść prowadzi do finału, w którym losy bohaterów związane są nierozerwalnie z ostatecznym losem całej floty Macross Frontier. „Macross F Movie 2: Sayonara no Tsubasa” to widowiskowe, poruszające anime, które łączy intensywne bitwy kosmiczne, dynamiczny trójkąt miłosny oraz niezapomniane wykonania muzyczne.
