Grupa terrorystyczna o nazwie Czerwone Siamese Cat przeprowadza spektakularny atak na gigantyczny sterowiec pasażerski unoszący się wysoko nad Japonią. Podczas tego napiętego rejsu na pokładzie znalazł się także młody detektyw Shinichi Kudo, znany wszystkim jako Conan Edogawa, wraz ze swoimi przyjaciółmi. Sytuacja szybko nabiera dramatyzmu, gdy terroryści grożą użyciem groźnego wirusa, stawiając pasażerów w obliczu realnego niebezpieczeństwa. Conan musi przeprowadzić błyskotliwe śledztwo i rozwiązując kolejne zagadki, przechytrzyć przestępców zanim zrealizują swoje plany. Tymczasem na pokładzie znajduje się także legendarny złodziej Kaito Kid, którego działania jeszcze bardziej komplikują sytuację. W atmosferze napięcia, humoru oraz pełnych akcji scen Conan po raz kolejny sprawdzi swoje dedukcyjne umiejętności, by uratować pasażerów i pokonać wyjątkowo przebiegłych przeciwników.
