Jest rok 0088 Uniwersalnego Wieku. Po zakończeniu krwawego konfliktu zwanego wojną Gryps, kosmiczna kolonia Side 1 staje się miejscem nowych chaotycznych wydarzeń. Wojna pomiędzy siłami Neo Zeonu dowodzonymi przez ambitnego Haman Karn a osłabioną Federacją Ziemską zaostrza się, grożąc kolejną eskalacją.
W centrum tych wydarzeń znajduje się Judau Ashta, młody zbieracz złomu z kolonii Shangri-La, który przypadkowo wkracza do walki, pilotując potężnego Mobile Suita – ZZ Gundama. Wraz z grupą przyjaciół, Judau dołącza do załogi statku Argama i angażuje się w konflikt, od którego zależy przyszłość kosmosu i Ziemi.
„Mobile Suit Gundam ZZ” charakteryzuje się początkowo lżejszą atmosferą i humorem niż jego poprzednicy, jednak wraz z rozwojem fabuły zaczynają dominować poważniejsze tematy związane z wojną, stratą oraz dorastaniem w obliczu konfliktu zbrojnego.
