Tadayasu Sawaki nie jest zwykłym studentem rolnictwa — posiada niezwykłą umiejętność, dzięki której potrafi gołym okiem dostrzegać i rozmawiać z mikroskopijnymi organizmami, takimi jak bakterie, grzyby czy drobnoustroje. Rozpoczynając swoją edukację na prestiżowym Uniwersytecie Rolniczym w Tokio, szybko przekonuje się, że jego nietypowy talent jest zarówno darem, jak i przekleństwem. Wraz z przyjaciółmi, ekscentrycznymi profesorami oraz oczywiście niezliczoną rzeszą mikroorganizmów, Tadayasu bierze udział w niezwykłych, często komediowych, a czasem edukacyjnych przygodach. Pełna humoru, naukowych ciekawostek i lekko absurdalnych sytuacji seria „Moyashimon” w zabawny sposób ukazuje życie studenckie oraz niezwykły świat bakterii, który otacza nas każdego dnia, ale pozostaje niewidoczny dla zwykłego człowieka.
