Dziesięcioletni mag w trakcie nauki, Negi Springfield, niespodziewanie otrzymuje nietypowe zadanie: ma zostać nauczycielem języka angielskiego w żeńskiej szkole Mahora Academy w Japonii. Szybko okazuje się, że zadanie to nie jest takie proste, gdyż klasa 2-A, do której trafia, liczy aż 31 niezwykle energicznych dziewcząt. Codzienne szkolne życie pełne jest komediowych sytuacji, osobliwych relacji, a także wyzwań związanych z utrzymaniem własnej magii w tajemnicy przed uczennicami. Sprawy komplikują się jeszcze bardziej, kiedy na terenie szkoły zaczynają pojawiać się dziwne magiczne stworzenia, zmuszając Negiego i jego uczennice do współpracy i walki przeciw tajemniczym siłom. „Negima!?” to pełna humoru, akcji i magii seria, ukazująca perypetie młodego czarodzieja nauczyciela w zwariowanym, barwnym świecie nastoletnich problemów, przyjaźni i przygód.
