Yuta Akikawa to zwyczajny chłopiec, który nie przepada za komputerami i technologią, mimo że przenosi się z rodziną do miasta Kamimai, najbardziej zaawansowanego technologicznie miejsca na świecie. Ku jego zdumieniu odkrywa, że internet zamieszkuje niezwykła grupa duchów zwanych „Net Ghosts”. Przypadkiem zaprzyjaźnia się z trzema zabawnymi duchami—Pitem, Potem, i Patem (w skrócie PiPoPa). Wspólnie podróżują przez świat wirtualny, rozwiązując rozmaite problemy cyfrowego świata, które mają bezpośrednie skutki w rzeczywistości. Jednak wkrótce zaczynają pojawiać się tajemnicze zagrożenia, a Yuta wraz z przyjaciółmi będzie musiał zmierzyć się ze złowrogimi siłami, które zagrażają harmonijnemu współistnieniu świata realnego z cyfrowym. Net Ghost Pipopa to anime utrzymane w pogodnym tonie z elementami humoru, przygody i tajemnicy, pełne pouczających przygód mówiących o przyjaźni oraz odpowiedzialnym korzystaniu z technologii.
