Po długich latach samotnej wędrówki ogromnym, pustym wszechświatem, statek kosmiczny Sidonia staje przed ostateczną próbą przetrwania ludzkości. Tajemnicza rasa obcych istot znanych jako Gauna nieustannie zagraża mieszkańcom Sidonii, zmuszając ich do ciągłej walki o przetrwanie oraz poszukiwania nowego domu. Młody pilot Garde, Nagate Tanikaze, ponownie zostaje postawiony przed decydującym zadaniem ochrony swojego okrętu i jego mieszkańców przed zniszczeniem. Zbliżająca się konfrontacja może okazać się ostatnią szansą ludzkości na znalezienie spokoju i nadziei na przyszłość. W tej pełnej akcji i emocji opowieści bohaterowie nie tylko mierzą się z zagrożeniem zewnętrznym, ale również zawiłościami wewnętrznych relacji i własnymi uczuciami. „Sidonia no Kishi Movie: Ai Tsumugu Hoshi” to poruszająca historia o odwadze, poświęceniu i sile więzi, które rodzą się nawet w obliczu największego niebezpieczeństwa.

