Paryż XIX wieku skrywa mroczny sekret — istnienie wampirów, istot żyjących w cieniu, które cierpią z powodu tajemniczej klątwy wypaczającej ich prawdziwą naturę. Noé Archiviste, młody wampir podróżujący w celu odnalezienia legendarnego „Księgi Vanitasa”, przedmiotu, który miałby umożliwić kontrolowanie klątwy, przypadkowo spotyka tajemniczego człowieka o imieniu Vanitas. Ów ekscentryczny lekarz posługujący się właśnie tą legendarną księgą deklaruje zamiar wyleczenia wszystkich wampirów ze zgubnego przekleństwa. Mimo początkowego braku zaufania, obaj zawiązują pełne niechęci partnerstwo, stając wobec spisków, niebezpieczeństw i głęboko skrywanych sekretów wampirzego społeczeństwa.

Vanitas no Carte w subtelny sposób łączy gotycką atmosferę z humorem, akcją i dramatem, przedstawiając opowieść o przyjaźni, zdradzie oraz granicy między potworem a człowiekiem.