„Mahou Sensei Negima!” to historia o Negim Springfieldzie, 10-letnim czarodzieju, który do zdobycia tytułu mistrza czarów brakuje mu już tylko jednego egzaminu. Niestety, jego ostatecznym zadaniem jest zostanie nauczycielem angielskiego w szkole z internatem dla dziewcząt. Już na samym początku wpada w oko jednej ze swoich uczennic, Asunie Kagurazace, zastępując nauczyciela, którego kochała, co zyskuje mu jej nienawiść. Sytuacja staje się jeszcze gorsza, gdy Asuna dowiaduje się, że Negi jest czarodziejem i grozi, że to ujawni, chyba że jej pomoże. Okoliczności zmusza ich jednak do współpracy – od walki ze złymi czarodziejami, przez pomoc klasie w zdaniu końcowego egzaminu, aż po zabawne sytuacje, magię i romans.