„Asagiri no Miko” to historia Tadahiro Amatsu, którego od dzieciństwa charakteryzują dwa różnie zabarwione oczy. Jego lewe oko kryje jednak mroczny sekret, który przyciąga uwagę tajemniczego czarodzieja Ayatary Miramune i jego demonów. Aby stawić czoła rosnącemu zagrożeniu zagrażającemu miastu, Yuzu Hieda, młoda adeptka sztuk kapłańskich, rekrutuje cztery koleżanki ze szkoły. Pod okiem starszej siostry Yuzu, Kurako, pięć dziewcząt przechodzi przez miesiące szkolenia, aby opanować swoje zdolności.