„Moeru! Onii-san” przedstawia historię Kenichiego Kokuho, chłopca, który jako dziecko zgubił się w górach i został wychowany przez mistrza karate stylu Cha Genmai. Gdy Kenichi kończy 15 lat, dowiaduje się o swoim prawdziwym pochodzeniu i powraca do cywilizacji oraz rodziny, której istnienia nawet się nie spodziewał. Przystosowanie się do nowego stylu życia w świecie, który jest mu całkowicie obcy, sprawia, że główny bohater często wpada w problemy, a jego dzika, bezkompromisowa natura prowadzi do wielu zabawnych sytuacji. W humorystycznym i lekkim tonie seria eksploruje przygody i zmagania Kenichiego z życiem codziennym, relacjami rodzinnymi oraz szkolnymi kłopotami, przedstawiając jednocześnie tematy odnalezienia swojej tożsamości w społeczeństwie.

