„Sabage-bu!” to historia o Momoka Sonokawa, która na swojej drodze do nowej szkoły średniej spotyka dziewczynę z dwoma pistoletami, Miou Ootori. Miou, jest starszą uczennicą Momoki i prezesem klubu gier survivalowych w Akademii Aogiri, znanym jako Sabage-bu. Widząc umiejętności Momoki z pistoletem, Miou próbuje przekonać ją do dołączenia do klubu. Mimo uporczywego odmawiania, Momoka niespodziewanie staje się członkiem Sabage-bu.
Sabage-bu to wszystko, tylko nie typowy klub szkolny. Członkowie klubu są społecznie niezręczni, a ich osobowości są ekstrawaganckie i dziwaczne. Chodzą po publicznych miejscach w maskujących kombinezonach, a nawet skaczą na bungee z budynku szkoły. Dziewczyna musi nauczyć się żyć w tym niespodziewanie dzikim szkolnym świecie pełnym maniaków gier survivalowych.